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3月16日，河南農(nóng)業(yè)大學(xué)康相濤教授團(tuán)隊(duì)基于前期雞泛基因組研究成果與公共數(shù)據(jù)，開(kāi)發(fā)了適用于我國(guó)地方雞基因組系列液相芯片——“神農(nóng)1號(hào)”。該系列芯片的成功研發(fā)，搭建了用于地方雞種質(zhì)資源鑒定、精準(zhǔn)評(píng)價(jià)、保護(hù)與開(kāi)發(fā)利用的高效技術(shù)平臺(tái)，對(duì)我國(guó)家禽種業(yè)振興與可持續(xù)發(fā)展具有重要的意義。

▲58個(gè)地方雞品種地理分布

該系列芯片采用模塊組合的設(shè)計(jì)思路：模塊I是利用66.5M泛基因組序列，設(shè)計(jì)5K標(biāo)記；模塊II是整合生長(zhǎng)、繁殖、屠體等性狀GWAS的功能位點(diǎn)，設(shè)計(jì)5K標(biāo)記；模塊III是整合我國(guó)58個(gè)地方雞種中高頻SNP位點(diǎn)，設(shè)計(jì)30K標(biāo)記；模塊IV是整合生長(zhǎng)、羽色等性狀的原因InDel、SV、PAV突變位點(diǎn)。集成上述模塊，創(chuàng)制了40K、5K地方雞基因組系列芯片——“神農(nóng)1號(hào)”。

▲“神農(nóng)1號(hào)”40K地方雞基因組芯片位點(diǎn)分布

▲“神農(nóng)1號(hào)”地方雞基因組液相芯片試劑盒

團(tuán)隊(duì)簡(jiǎn)介

河南農(nóng)業(yè)大學(xué)家禽團(tuán)隊(duì)是教育部、農(nóng)業(yè)部科研創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)?，F(xiàn)有16名骨干成員，其中教授9人、副教授3人。團(tuán)隊(duì)帶頭人康相濤教授先后榮獲全國(guó)先進(jìn)工作者、中華農(nóng)業(yè)英才獎(jiǎng)和首屆國(guó)際種業(yè)科學(xué)家獎(jiǎng)等。團(tuán)隊(duì)長(zhǎng)期圍繞地方雞種質(zhì)資源保護(hù)和利用開(kāi)展研究，先后主持承擔(dān)國(guó)家“863”計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金、神農(nóng)種業(yè)實(shí)驗(yàn)室“一流課題”項(xiàng)目等國(guó)家和省部級(jí)科研項(xiàng)目；主持培育國(guó)審新品種2個(gè)，完成的《中國(guó)地方雞種質(zhì)資源優(yōu)異性狀發(fā)掘創(chuàng)新與應(yīng)用》獲國(guó)家技術(shù)發(fā)明獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)、《地方雞保護(hù)利用技術(shù)體系創(chuàng)建與應(yīng)用》獲國(guó)家科學(xué)技術(shù)進(jìn)步獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)，授權(quán)國(guó)家發(fā)明專(zhuān)利46項(xiàng)，制定國(guó)家和地方標(biāo)準(zhǔn)10項(xiàng)，發(fā)表中英文論文500余篇。

上述研究成果的取得主要依托于神農(nóng)種業(yè)實(shí)驗(yàn)室、農(nóng)業(yè)農(nóng)村部畜禽資源（家禽）評(píng)價(jià)利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、河南省雞種質(zhì)資源創(chuàng)新與利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、河南省家禽育種國(guó)際聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室和河南省家禽種質(zhì)資源創(chuàng)新工程研究中心等省部級(jí)研究平臺(tái)，以及保存了29個(gè)特色資源、設(shè)施設(shè)備一流的河南農(nóng)業(yè)大學(xué)家禽種質(zhì)資源場(chǎng)。