河南農(nóng)大陳鋒教授團(tuán)隊(duì)在小麥株型調(diào)控分子機(jī)制方面取得重要進(jìn)展

?智能總結(jié)2022年9月21日,國(guó)際知名學(xué)術(shù)期刊Plant Biotechnology Journal在線發(fā)表了河南農(nóng)業(yè)大學(xué)完成的題為“A HST1-like gene controlled tiller angle through regulating endogenous auxin in common wheat”的研究論文。
分蘗角度是小麥重要農(nóng)藝性狀之一,同時(shí)也是小麥理想株型構(gòu)成的關(guān)鍵因素,其影響小麥群體的光合效率與適應(yīng)性,與小麥產(chǎn)量密切相關(guān)。培育分蘗角度適中的小麥品種能夠有效地提高群體產(chǎn)量;解析小麥分蘗角度形成的分子調(diào)控機(jī)制可為小麥株型的遺傳改良提供理論參考和基因資源。然而目前關(guān)于小麥分蘗角度基因克隆的研究仍鮮有報(bào)道,分子機(jī)制與作用網(wǎng)絡(luò)仍不清晰。
2022年9月21日,國(guó)際知名學(xué)術(shù)期刊Plant Biotechnology Journal在線發(fā)表了河南農(nóng)業(yè)大學(xué)完成的題為“A HST1-like gene controlled tiller angle through regulating endogenous auxin in common wheat”的研究論文。該研究利用正向遺傳學(xué)手段克隆出控制小麥分蘗角度的重要基因TaHST1L,對(duì)其基因功能進(jìn)行驗(yàn)證,并對(duì)其作用機(jī)制進(jìn)行解析;研究同時(shí)對(duì)該基因序列變異進(jìn)行分析,鑒定出有利單倍型并對(duì)其遺傳演化進(jìn)程進(jìn)行追蹤。該成果不僅加深了對(duì)小麥株型遺傳基礎(chǔ)的理解,同時(shí)為小麥株型和產(chǎn)量的分子改良提供了重要基因資源和理論基礎(chǔ)。
作者利用包含349份小麥品系的自然群體進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS),在5A染色體上520–528 Mb區(qū)段內(nèi)檢測(cè)到一個(gè)調(diào)控小麥分蘗角度的主效遺傳位點(diǎn);同時(shí)利用一個(gè)分蘗角度顯著減小的四倍體Kronos突變體(K2588),構(gòu)建F2分離群體,通過(guò)BSA混池分析方法在相同染色體區(qū)段定位到控制小麥分蘗角度的遺傳位點(diǎn);通過(guò)分析認(rèn)為兩種定位方法檢測(cè)到的為同一基因位點(diǎn),并進(jìn)一步將其限定在524.05–527.94 Mb之間、長(zhǎng)約3.89-Mb的染色體區(qū)間內(nèi)。進(jìn)而借助BSR-seq方法,通過(guò)差異表達(dá)基因分析與序列分析確定TraesCS5A02G316400為候選基因。該基因注釋為NAD依賴(lài)性脫乙酰酶HST1-like基因,將其命名為T(mén)aHST1L。
為了對(duì)候選基因功能進(jìn)行初步驗(yàn)證,作者自四倍體小麥Kronos的EMS突變體庫(kù)中分別篩選出候選基因A、B亞基因組提前終止類(lèi)型的突變體,K2588(aaBB)與K1242(AAbb),通過(guò)與野生型回交純合背景,同時(shí)兩個(gè)突變體間進(jìn)行雜交構(gòu)建雙突變體。表型鑒定結(jié)果顯示,A組突變體aaBB和雙突變體aabb與野生型相比,分蘗角度顯著減小,同時(shí)分蘗數(shù)也顯著降低,表明TaHST1L確實(shí)可能參與調(diào)控小麥分蘗模式。
為進(jìn)一步明確TaHST1L功能,通過(guò)遺傳轉(zhuǎn)化獲得候選基因的過(guò)表達(dá)植株及基因沉默植株,進(jìn)行功能互補(bǔ)驗(yàn)證。同野生型相比,在輪選987與Fielder兩種背景下的過(guò)表達(dá)植株分蘗角度均顯著增大,同時(shí)分蘗數(shù)目也也顯著增加;RNAi植株則表現(xiàn)為相反的趨勢(shì),分蘗角度及分蘗數(shù)目同野生型相比均顯著降低。上述結(jié)果確定了TaHST1L的功能及候選基因的正確性。
為解析TaHST1L調(diào)控小麥分蘗角度的潛在作用機(jī)制,作者利用TaHST1L進(jìn)行酵母文庫(kù)篩選互作蛋白,鑒定出一個(gè)參與生長(zhǎng)素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的蛋白TaIAA17,并通過(guò)酵母雙雜交和熒光素酶互補(bǔ)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證;煙草共表達(dá)及免疫印跡分析(Western-blot)進(jìn)一步驗(yàn)證互作關(guān)系的存在,表明TaHST1L可能抑制TaIAA17的積累。對(duì)TaIAA17基因提前終止突變體的表型鑒定也表明該基因參與調(diào)控小麥分蘗角度。上述結(jié)果暗示TaHST1L可能通過(guò)與TaIAA17互作參與生長(zhǎng)素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。為驗(yàn)證這一猜想,對(duì)TaHST1L過(guò)表達(dá)植株進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,結(jié)果顯示共檢測(cè)到143個(gè)參與生長(zhǎng)素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的差異表達(dá)基因,26個(gè)可能參與生長(zhǎng)素生物合成的差異表達(dá)基因。利用過(guò)表達(dá)植株進(jìn)行代謝組學(xué)分析結(jié)果,顯示9個(gè)差異代謝物參與色氨酸代謝或生長(zhǎng)素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。隨后對(duì)轉(zhuǎn)基因株系中內(nèi)源生長(zhǎng)素含量進(jìn)行測(cè)定,結(jié)果顯示,同野生型相比,過(guò)表達(dá)植株中的生長(zhǎng)素含量顯著增加,而RNAi植株則顯著降低。綜合上述結(jié)果,推測(cè)TaHST1L通過(guò)與TaIAA17相互作用介導(dǎo)生長(zhǎng)素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路,在調(diào)節(jié)內(nèi)源生長(zhǎng)素水平方面發(fā)揮了積極的關(guān)鍵作用,從而影響小麥分蘗模式。
進(jìn)一步對(duì)現(xiàn)代小麥品種中的TaHST1L基因序列進(jìn)行測(cè)序分析,結(jié)果顯示啟動(dòng)子區(qū)域存在較大序列差異,并依據(jù)變異信息區(qū)分為3種基因單倍型。其中TaHST1L-A1a和TaHST1L-A1b兩種單倍型的主要差異是位于啟動(dòng)子上的242-bp的插入缺失。對(duì)兩種單倍型遺傳效應(yīng)分析顯示,具有TaHST1L-A1b單倍型的品種較具有TaHST1L-A1a單倍型的品種擁有更大的分蘗角度,并據(jù)此推測(cè)含有242-bp插入的TaHST1L-A1b單倍型具有更強(qiáng)的轉(zhuǎn)錄活性。煙草系統(tǒng)中的GUS活性測(cè)定實(shí)驗(yàn)以及轉(zhuǎn)基因水稻表型鑒定進(jìn)一步證實(shí)了這個(gè)猜想。上述結(jié)果表明位于啟動(dòng)子上的242-bp的插入片段顯著影響TaHST1L-A1的表達(dá),并由此改變小麥植株的分蘗角度。
進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),過(guò)表達(dá)TaHST1L-A1基因能夠顯著增加產(chǎn)量,而突變體則表現(xiàn)為產(chǎn)量降低。對(duì)243份小麥品種產(chǎn)量進(jìn)行調(diào)查分析,結(jié)果顯示同具有TaHST1L-A1a單倍型的品種相比,具有TaHST1L-A1b單倍型的品種具有更高的小區(qū)產(chǎn)量。因此認(rèn)為T(mén)aHST1L-A1b為產(chǎn)量?jī)?yōu)良單倍型。進(jìn)而對(duì)1140份小麥種質(zhì)材料中的基因單倍型進(jìn)行鑒定與分析,結(jié)果顯示TaHST1L-A1b單倍型在地方品種中占比為5.9%,歷史品種中占比34.5%,但在現(xiàn)代品種中占比高達(dá)66.0%,表明在TaHST1L-A1b單倍型在當(dāng)前小麥育種中已被強(qiáng)烈馴化,同時(shí)也表明TaHST1L具有通過(guò)改良株型來(lái)提高小麥產(chǎn)量的潛力。進(jìn)化分析顯示TaHST1L-A1b可能來(lái)源于野生二粒小麥,并在栽培二粒小麥和圓錐小麥中經(jīng)過(guò)人工馴化得以保留。
河南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院趙磊副教授、博士生鄭躍婷和王盈為論文的共同第一作者,陳鋒教授為本文通訊作者,王沙沙、張坤普、張寧和董中東參與了此項(xiàng)工作。本課題從基因定位和克隆、功能驗(yàn)證、分子機(jī)制解析和進(jìn)化分析,到最終發(fā)表,歷時(shí)11年,感謝為本工作默默無(wú)聞付出的各位老師和同學(xué)。本研究得到了國(guó)家自然科學(xué)基金、河南省重大科技專(zhuān)項(xiàng)、河南省科技攻關(guān)等項(xiàng)目的資助。
(本文轉(zhuǎn)載自河南農(nóng)業(yè)大學(xué)經(jīng)濟(jì)與管理學(xué)院 ,如有侵權(quán)請(qǐng)電話(huà)聯(lián)系13810995524)
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